Théorie DGE : métadonnées

Utilisez les informations ci-dessous pour créer une table de métadonnées pour les comptages de fibrose appelée metadata, avec les colonnes genotype et condition. Les noms d’échantillons (par ex. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, etc.) doivent être les noms de lignes de la table :

smoc2 metadata

Cet exercice fait partie du cours

RNA-Seq avec Bioconductor en R

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Instructions

Créez un vecteur de caractères nommé genotype pour les données ci-dessus en utilisant c().
Créez un vecteur de caractères nommé condition pour les données ci-dessus en utilisant c().
Créez une table de données nommée smoc2_metadata en utilisant data.frame() et les vecteurs de caractères genotype et condition.
Créez un vecteur de noms d’échantillons avec c() et affectez-le aux noms de lignes de la table à l’aide de rownames().

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)

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