Packages RNA-Seq
Nous utiliserons DESeq2 pour réaliser l’analyse d’expression différentielle, ainsi que d’autres packages R pour la manipulation de données et la visualisation. Avant de lancer la moindre analyse, nous devons charger les packages suivants : DESeq2, RColorBrewer, pheatmap et tidyverse.
Cet exercice fait partie du cours
RNA-Seq avec Bioconductor en R
Instructions
- À l’aide de
library(), importez les packagesDESeq2,RColorBrewer,pheatmapettidyverse.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Load library for DESeq2
library(___)
# Load library for RColorBrewer
library(___)
# Load library for pheatmap
library(___)
# Load library for tidyverse
library(___)