S’entraîner avec la vignette DESeq2

Dans les vidéos, nous étudions les différences d’expression génique entre des échantillons normaux et fibrosés chez des souris de type sauvage. Dans ces exercices, nous allons explorer l’expression génique entre des échantillons normaux et fibrosés chez des souris qui sur‑expriment le gène smoc2.

Lorsque vous réalisez vos propres analyses d’expression différentielle, la vignette DESeq2 est la première ressource à consulter pour répondre à vos questions. Dans cet exercice, explorez la vignette DESeq2 et utilisez-la pour choisir la meilleure réponse ci‑dessous à la question :

Pourquoi utilisons‑nous des comptes non normalisés comme entrée pour DESeq2 ?

REMARQUE : Non normalisé signifie que les comptes n’ont pas été ajustés pour la taille de bibliothèque, c’est‑à‑dire le nombre total de lectures comptées par échantillon.