Résumer les résultats DESeq2
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Maintenant que nous avons extrait nos résultats, nous pouvons obtenir une vue d’ensemble du nombre de gènes différentiellement exprimés pour notre niveau alpha défini à l’aide de la fonction summary(). Elle affichera les nombres/pourcentages de gènes sur- et sous‑régulés, ainsi que des informations sur le filtrage indépendant et les valeurs aberrantes supprimées.
Cet exercice fait partie du cours
RNA-Seq avec Bioconductor en R
Instructions
- Vérifiez combien de gènes sont différentiellement exprimés dans nos résultats,
smoc2_res, en utilisant la fonctionsummary()deDESeq2.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Get an overview of the results
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