Перестановочный тест: дикий тип против гетерозиготы
Проверьте гипотезу о том, что длительности периодов активности у гетерозиготных особей и особей дикого типа подчиняются одному и тому же распределению, используя перестановочный тест.
Это упражнение является частью курса
Примеры применения статистического мышления
Инструкции к упражнению
- Вычислите разность средних (длительности периодов активности гетерозиготы минус дикий тип) для реальных наборов данных и сохраните результат в переменную
diff_means_exp. Массивыnumpybout_lengths_wtиbout_lengths_hetуже доступны в вашем пространстве имён. - Сгенерируйте 10 000 перестановочных реплик разности средних с помощью
dcst.draw_perm_reps(). Также можно использовать функциюdcst.diff_of_means(), сохранив результат вperm_reps. - Вычислите p-значение, трактуя «не менее экстремальным» случай, когда разность средних при нулевой гипотезе больше наблюдаемой экспериментально или равна ей.
- Выведите p-значение на экран.
Интерактивное практическое упражнение
Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.
# Compute the difference of means: diff_means_exp
diff_means_exp = ____ - ____
# Draw permutation replicates: perm_reps
perm_reps = ____(____, ____,
____, size=____)
# Compute the p-value: p-val
p_val = ____(____ >= ____) / len(____)
# Print the result
print('p =', p_val)