НачатьНачать бесплатно

Перестановочный тест: дикий тип против гетерозиготы

Проверьте гипотезу о том, что длительности периодов активности у гетерозиготных особей и особей дикого типа подчиняются одному и тому же распределению, используя перестановочный тест.

Это упражнение является частью курса

Примеры применения статистического мышления

Посмотреть курс

Инструкции к упражнению

  • Вычислите разность средних (длительности периодов активности гетерозиготы минус дикий тип) для реальных наборов данных и сохраните результат в переменную diff_means_exp. Массивы numpy bout_lengths_wt и bout_lengths_het уже доступны в вашем пространстве имён.
  • Сгенерируйте 10 000 перестановочных реплик разности средних с помощью dcst.draw_perm_reps(). Также можно использовать функцию dcst.diff_of_means(), сохранив результат в perm_reps.
  • Вычислите p-значение, трактуя «не менее экстремальным» случай, когда разность средних при нулевой гипотезе больше наблюдаемой экспериментально или равна ей.
  • Выведите p-значение на экран.

Интерактивное практическое упражнение

Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.

# Compute the difference of means: diff_means_exp
diff_means_exp = ____ - ____

# Draw permutation replicates: perm_reps
perm_reps = ____(____, ____, 
                               ____, size=____)

# Compute the p-value: p-val
p_val = ____(____ >= ____) / len(____)

# Print the result
print('p =', p_val)
Редактировать и запускать код