Teoria DGE: metadane
Skorzystaj z poniższych informacji, aby utworzyć ramkę danych z metadanymi dla danych zliczeniowych fibrozy. Nazwij ją metadata i dodaj kolumny genotype oraz condition. Nazwy próbek (np. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 itd.) powinny stanowić nazwy wierszy ramki danych:
To ćwiczenie jest częścią kursu
RNA-Seq z Bioconductor w R
Instrukcje do ćwiczenia
- Utwórz wektor znakowy o nazwie
genotypedla powyższych danych, używając funkcjic(). - Utwórz wektor znakowy o nazwie
conditiondla powyższych danych, używając funkcjic(). - Utwórz ramkę danych o nazwie
smoc2_metadata, używając funkcjidata.frame()oraz wektorów znakowychgenotypeicondition. - Utwórz wektor nazw próbek za pomocą
c()i przypisz go do nazw wierszy ramki danych, używając funkcjirownames().
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)