1. Nauka
    2. /
  2. Kursy
    3. /
  3. RNA-Seq z Bioconductor w R
Connected

ćwiczenie

Podsumowanie wyników DESeq2

UWAGA: Wczytanie tego ćwiczenia może chwilę potrwać.

Mając już wyodrębnione wyniki, możemy uzyskać przejrzysty przegląd liczby różnicowo ekspresjonowanych genów dla wybranego poziomu alfa – za pomocą funkcji summary(). Funkcja ta zwraca liczby i wartości procentowe genów z podwyższoną i obniżoną ekspresją, a także informacje o niezależnym filtrowaniu i usuniętych obserwacjach odstających.

Instrukcje

100 XP
  • Sprawdź, ile genów jest różnicowo ekspresjonowanych w wynikach smoc2_res, korzystając z funkcji summary() pakietu DESeq2.