ヒストグラムの比較
組織のセグメンテーションが不十分な場合、複数の組織タイプが混在するため、輝度値の分布が広くなり、ばらつきも大きくなります。
一方、左心室が完全にセグメンテーションされていれば、血液に関連するピクセルのみが含まれるため、セグメンテーションされた値のヒストグラムはほぼ釣り鐘型になるはずです。
この演習では、vol 内の以下のピクセルセットについて輝度値の分布を比較しましょう。labels および index 引数にも対応している ndi.histogram を使用します。
この演習はコースの一部です
Python による生体医療画像解析
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Create histograms for selected pixels
hist1 = ndi.histogram(vol, min=0, max=255, bins=256)
hist2 = ndi.histogram(vol, 0, 255, 256, labels=____)
hist3 = ndi.histogram(vol, 0, 255, 256, labels=____, index=____)