始める無料で始める

マスクを調整する

不完全なマスクは、ピクセルの追加や削除によって調整できます。SciPy には、こうした操作に役立つメソッドがいくつか用意されています。

  • binary_dilation：端に沿ってピクセルを追加する
  • binary_erosion：端に沿ってピクセルを削除する
  • binary_opening：収縮してから膨張させ、端付近の領域を「開く」
  • binary_closing：膨張してから収縮させ、穴を「埋める」

この演習では、ボーンマスクを作成し、さらにピクセルを追加して調整しましょう。

以降の演習では、次のインポートをあらかじめ実行しています。

import scipy.ndimage as ndi

この演習はコースの一部です

Python による生体医療画像解析

コースを見る

演習の手順

  • im から 145 以上のピクセルを選択して、ボーン（骨）領域を作成します。
  • ndi.binary_dilation() を使って mask_bone のサイズを拡大します。膨張を複数回行うために、iterations を 5 に設定してください。
  • ndi.binary_closing() を使って mask_bone の穴を埋めます。最大10ピクセル幅の穴を埋めるために、iterations を 5 に設定してください。
  • 元のマスクと調整後のマスクをプロットします。

実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Create and tune bone mask
mask_bone = ____
mask_dilate = ndi.binary_dilation(____, ____)
mask_closed = ____

# Plot masked images
fig, axes = plt.subplots(1,3)
axes[0].imshow(mask_bone)
axes[1].imshow(mask_dilate)
____
format_and_render_plot()
コードを編集して実行