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平行移動

この章では、Open Access Series of Imaging Studies のデータを活用して、若者と高齢者、男性と女性、健康な人とそうでない人など、異なる集団の脳を比較していきます。

まず、3D 脳ボリューム(im)の 1 スライスを中央に配置しましょう。画像配列の中心点と脳の重心を求め、その差分を使って画像を中央に移動させます。

この章の演習では、以下のインポートがすでに行われています。

import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt

この演習はコースの一部です

Python による生体医療画像解析

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実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Find image center of mass
com = ____

# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____

# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)
コードを編集して実行