平行移動
この章では、Open Access Series of Imaging Studies のデータを活用して、若者と高齢者、男性と女性、健康な人とそうでない人など、異なる集団の脳を比較していきます。
まず、3D 脳ボリューム(im)の 1 スライスを中央に配置しましょう。画像配列の中心点と脳の重心を求め、その差分を使って画像を中央に移動させます。
この章の演習では、以下のインポートがすでに行われています。
import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt
この演習はコースの一部です
Python による生体医療画像解析
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Find image center of mass
com = ____
# Calculate amount of shift needed
d0 = 128 - _____
d1 = ____
# Translate the brain towards the center
xfm = ndi.shift(____, shift=____)