ボリュームの読み込み
ImageIO の volread() 関数を使うと、多次元データセットを読み込み、複数の画像が格納されたフォルダから 3D ボリュームを作成できます。また、複数の画像にまたがるメタデータをまとめて取得することも可能です。
この演習では、25 枚の DICOM 画像が含まれる "tcia-chest-ct" フォルダから、胸部データのボリューム全体を読み込みましょう。
この演習はコースの一部です
Python による生体医療画像解析
演習の手順
volread()を使って、"tcia-chest-ct" ディレクトリを読み込みましょう。vol.metaのkeys()メソッドを使って、利用可能なメタデータを表示しましょう。- ボリュームの
shapeを表示しましょう。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Import ImageIO
import imageio.v2 as ____
# Load the "tcia-chest-ct" directory
vol = ____
# Print image attributes
print('Available metadata:', ____)
print('Shape of image array:', ____)