Selang kredibel posterior
Fokuslah pada parameter kemiringan \(b\), yaitu laju perubahan berat terhadap tinggi. Rata-rata posterior dari \(b\) mencerminkan tren dalam model posterior untuk kemiringan. Sebaliknya, selang kredibel posterior memberikan rentang nilai kemiringan yang masuk akal secara posterior, sehingga mencerminkan ketidakpastian posterior tentang \(b\). Sebagai contoh, selang kredibel 95% untuk \(b\) membentang dari kuantil ke-2,5 hingga ke-97,5 dari posterior \(b\). Dengan demikian, ada peluang 95% (posterior) bahwa \(b\) berada dalam rentang ini.
Anda akan menggunakan keluaran simulasi RJAGS untuk mendekati selang kredibel bagi \(b\). Simulasi RJAGS 100.000 iterasi dari posterior, weight_sim_big, ada di ruang kerja Anda beserta sebuah data frame keluaran rantai Markov, weight_chains.
Latihan ini merupakan bagian dari kursus
Pemodelan Bayesian dengan RJAGS
Instruksi latihan
- Peroleh statistik
summary()dari rantaiweight_sim_big. - Kuantil posterior
2.5%dan97.5%untuk \(b\) dilaporkan pada Tabel 2 darisummary(). Terapkanquantile()padaweight_chainsmentah untuk memverifikasi perhitungan ini. Simpan sebagaici_95dan cetak. - Dengan cara serupa, gunakan data
weight_chainsuntuk membangun selang kredibel 90% untuk \(b\). Simpan sebagaici_90dan cetak. - Bangun plot kerapatan dari nilai rantai Markov \(b\). Tumpangtindihkan garis vertikal yang merepresentasikan selang kredibel 90% untuk \(b\) menggunakan
geom_vline()denganxintercept = ci_90.
Latihan interaktif langsung praktik
Cobalah latihan ini dengan melengkapi kode contoh ini.
# Summarize the posterior Markov chains
# Calculate the 95% posterior credible interval for b
ci_95 <- quantile(___, probs = c(___, ___))
ci_95
# Calculate the 90% posterior credible interval for b
ci_90 <- ___
ci_90
# Mark the 90% credible interval
ggplot(___, aes(x = ___)) +
geom_density() +
geom_vline(xintercept = ___, color = "red")