建立 DE 物件
注意： 載入此練習可能會花較久的時間。
使用 smoc2 過度表現（overexpression）樣本，建立 DESeq2 物件，並在設計公式中指定纖維化樣本與正常樣本之間表現量差異的比較。實驗的中介資料如下所示。我們已經讀入資料，且樣本順序在 smoc2 原始計數 reordered_smoc2_rawcounts 與中介資料 smoc2_metadata 中相同。
本練習屬於課程
使用 R 與 Bioconductor 進行 RNA-Seq
練習說明
使用
DESeqDataSetFromMatrix()函式建立名為dds_smoc2的 DESeq2 物件，並指定參數：countData、colData、design。執行
DESeq()函式，以估計 size factors、計算離差（dispersion），並進行模型擬合與檢定。
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼，體驗一下這個練習。
# Create DESeq2 object
dds_smoc2 <- ___(___ = ___,
___ = ___,
___ = ~ condition)
# Run the DESeq2 analysis
___ <- ___(___)