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彙整 DESeq2 結果

注意: 載入這個練習可能需要多一點時間。

現在我們已經擷取了結果,可以用 summary() 函式,針對指定的 alpha 層級,快速總覽有多少差異表現基因。輸出會包含上調與下調基因的數量與百分比,也會提供關於獨立過濾(independent filtering)與移除離群值的資訊。

本練習屬於課程

使用 R 與 Bioconductor 進行 RNA-Seq

檢視課程

練習說明

  • 使用 DESeq2summary() 函式,查看在 smoc2_res 中有多少基因為差異表現基因。

動手互動練習

試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。

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編輯並執行程式碼