DESeq2 顯著結果
注意: 載入此練習可能需要多一點時間。
現在來擷取顯著的結果吧!假設你已經有上一個練習產生的結果物件 smoc2_res。
本練習屬於課程
使用 R 與 Bioconductor 進行 RNA-Seq
練習說明
使用
data.frame()將結果物件smoc2_res轉成並儲存為 data frame。使用
subset()函式,篩選出調整後 p 值小於 0.05(alpha 值)的顯著基因。
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)
# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)