Практика з віньєткою DESeq2

У відео ми досліджуємо відмінності експресії генів між нормальними та фіброзними зразками у мишей дикого типу. У цій вправі ми розглядатимемо експресію генів між нормальними та фіброзними зразками у мишей з надлишковою експресією гена smoc2.

Коли ви самостійно виконуєте аналіз диференціальної експресії, віньєтка DESeq2 — це перше місце, де варто шукати відповіді. У цій вправі перегляньте віньєтку DESeq2 і за її допомогою оберіть найкращу відповідь на запитання нижче:

Чому ми використовуємо ненормалізовані підрахунки як вхід для DESeq2?

Примітка: Ненормалізовані означає, що підрахунки не були скориговані на розмір бібліотеки, тобто на загальну кількість рідів, підрахованих для кожної вибірки.