Значущі результати DESeq2

ПРИМІТКА: завантаження цієї вправи може тривати трохи довше.

Тепер дістаньмо значущі результати! Припустімо, що ми вже маємо витягнуті результати з попередньої вправи — smoc2_res.

Ця вправа є частиною курсу

RNA-Seq з Bioconductor у R

Переглянути курс

Інструкції до вправи

Збережіть результати smoc2_res як датафрейм, застосувавши до об'єкта результатів функцію data.frame().
Добудьте значущі гени з p-adjusted значеннями, меншими за 0,05 (значення альфа), за допомогою функції subset().

Інтерактивна практична вправа

Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.

# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)

# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)

Редагувати та запускати код