Підсумування результатів DESeq2
ПРИМІТКА: Завантаження цієї вправи може тривати трохи довше.
Тепер, коли ми отримали результати, можна оглянути, скільки генів є диференційовано експресованими для заданого рівня alpha, використавши функцію summary(). Вона виведе кількість/відсоток генів із підвищеною та зниженою експресією, а також надасть інформацію про незалежну фільтрацію та вилучені викиди.
Ця вправа є частиною курсу
RNA-Seq з Bioconductor у R
Інструкції до вправи
- Перевірте, скільки генів диференційовано експресовані в наших результатах
smoc2_res, за допомогою функціїsummary()зDESeq2.
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Get an overview of the results
___