RNA-Seq-pakketten
We gebruiken DESeq2 voor de differentiële-expressieanalyse en aanvullende R-pakketten voor datawrangling en visualisatie. Voordat we analyses kunnen uitvoeren, moeten we de volgende pakketten laden: DESeq2, RColorBrewer, pheatmap en tidyverse.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
RNA-Seq met Bioconductor in R
Oefeninstructies
- Importeer met
library()de pakkettenDESeq2,RColorBrewer,pheatmapentidyverse.
Interactieve oefening met praktijkervaring
Probeer deze oefening door deze voorbeeldcode aan te vullen.
# Load library for DESeq2
library(___)
# Load library for RColorBrewer
library(___)
# Load library for pheatmap
library(___)
# Load library for tidyverse
library(___)