Teoria DGE: Metadati

Usa le informazioni qui sotto per creare un data frame di metadati per i dati di conteggio della fibrosi chiamato metadata con le colonne genotype e condition. I nomi dei campioni (ad es. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, ecc.) devono essere i nomi di riga del data frame:

smoc2 metadata

Questo esercizio fa parte del corso

RNA-Seq con Bioconductor in R

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Istruzioni dell'esercizio

Crea un vettore di caratteri chiamato genotype per i dati sopra usando c().
Crea un vettore di caratteri chiamato condition per i dati sopra usando c().
Crea un data frame chiamato smoc2_metadata usando data.frame() e i vettori di caratteri genotype e condition.
Crea un vettore di nomi dei campioni usando c() e assegnalo ai nomi di riga del data frame usando rownames().

esercizio interattivo pratico

Prova questo esercizio completando questo codice di esempio.

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)

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