Esercitati con la vignetta di DESeq2

Nei video, stiamo esplorando le differenze di espressione genica tra i campioni normali e quelli con fibrosi di topi wild-type. In questi esercizi, esplorerai l'espressione genica tra i campioni normali e quelli con fibrosi di topi che sovraesprimono il gene smoc2.

Quando esegui analisi di espressione differenziale in autonomia, la vignetta di DESeq2 è il primo posto in cui cercare risposte ai tuoi dubbi. In questo esercizio, esplora la vignetta di DESeq2 e usala per scegliere qui sotto la risposta migliore alla domanda:

Perché usiamo conteggi non normalizzati come input per DESeq2?

NOTA: Non normalizzati significa che i conteggi non sono stati corretti per la dimensione della libreria, cioè il numero totale di read conteggiati per campione.