Konstruksi himpunan data NHANES

Seperti diunduh dari situs web NHANES, himpunan data NHANES hanya tersedia sebagai berkas .XPT terpisah, format asli SAS. Untungnya, paket haven tersedia.

Mari gabungkan himpunan data Demographics, Medical Conditions, dan Body Measures dari NHANES, yang tersedia dalam format mentah .XPT dan dapat diakses melalui variabel DEMO_file, MCQ_file, dan BMX_file. Gabungkan ketiga himpunan data tersebut menggunakan variabel SEQN. Cara yang baik untuk melakukan ini adalah menggunakan Reduce(), yang memungkinkan Anda menggabungkan elemen dengan cara yang bermanfaat.

Kode penggabungan yang disediakan untuk Anda melakukan hal-hal berikut:

Membuat daftar dari ketiga himpunan data (nhanes_demo, nhanes_medical, nhanes_bodymeasures).
Menggunakan fungsi kustom di dalam Reduce() untuk melakukan inner join pada ketiga himpunan data dengan variabel "SEQN".
Menyimpannya sebagai himpunan data nhanes_combined.

Latihan ini adalah bagian dari kursus

Perancangan Eksperimen di R

Lihat Kursus

Petunjuk latihan

Muat paket haven.
Impor ketiga berkas data dengan pemanggilan terpisah ke read_xpt(), dengan masukan untuk 3 pemanggilan read_xpt() tersebut adalah DEMO_file, MCQ_file, dan BMX_file, lalu simpan sebagai himpunan data nhanes_demo, nhanes_medical, dan nhanes_bodymeasures secara berurutan.
Buat nhanes_combined dengan menggabungkan ketiga himpunan data yang baru Anda impor, menggunakan kode yang disediakan.

Latihan interaktif praktis

Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.

# Load haven
___

# Import the three datasets using read_xpt()
nhanes_demo <- read_xpt(DEMO_file)
___
___

# Merge the 3 datasets you just created to create nhanes_combined
nhanes_combined <- list(nhanes_demo, nhanes_medical, nhanes_bodymeasures) %>%
  Reduce(function(df1, df2) inner_join(df1, df2, by = "SEQN"), .)

Edit dan Jalankan Kode