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DGE थ्योरी: मेटाडेटा

नीचे दी गई जानकारी का उपयोग करके fibrosis काउंट डेटा के लिए metadata नाम का एक मेटाडेटा data frame बनाएँ, जिसमें कॉलम genotype और condition हों। सैंपल नाम (जैसे smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, आदि) data frame के row names होने चाहिए:

smoc2 metadata

यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है

R में Bioconductor के साथ RNA-Seq

पाठ्यक्रम देखें

अभ्यास निर्देश

  • ऊपर दिए गए डेटा के लिए c() का उपयोग करके genotype नाम का एक character वेक्टर बनाएँ।
  • ऊपर दिए गए डेटा के लिए c() का उपयोग करके condition नाम का एक character वेक्टर बनाएँ।
  • data.frame() और genotype तथा condition character वेक्टरों का उपयोग करके smoc2_metadata नाम का data frame बनाएँ।
  • c() का उपयोग करके सैंपल नामों का एक वेक्टर बनाएँ और rownames() का उपयोग करके उसे data frame के row names के रूप में असाइन करें।

इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास

इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)
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