DESeq2 विन्येट के साथ अभ्यास
वीडियो में, हम वाइल्ड-टाइप चूहों के नॉर्मल और फाइब्रोसिस सैंपल्स के बीच जीन एक्सप्रेशन के अंतर की जाँच कर रहे हैं. इन अभ्यासों में, हम उन चूहों के नॉर्मल और फाइब्रोसिस सैंपल्स के बीच जीन एक्सप्रेशन का अध्ययन करेंगे जिनमें smoc2 जीन का ओवर-एक्सप्रेशन है.
जब आप स्वयं डिफरेंशियल एक्सप्रेशन विश्लेषण करते हैं, तो किसी भी प्रश्न का उत्तर खोजने के लिए DESeq2 विन्येट आपकी पहली मंज़िल होनी चाहिए. इस अभ्यास में, DESeq2 विन्येट देखें और इसका उपयोग करके नीचे दिए गए प्रश्न का सबसे उपयुक्त उत्तर चुनें:
हम DESeq2 के इनपुट के रूप में unnormalized काउंट्स का उपयोग क्यों करते हैं?
नोट: Unnormalized का अर्थ है कि काउंट्स को लाइब्रेरी साइज के अनुसार समायोजित नहीं किया गया है, जहाँ लाइब्रेरी साइज प्रति सैंपल गिने गए कुल रीड्स की संख्या होती है.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ RNA-Seq
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
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