DESeq2 के महत्वपूर्ण परिणाम
नोट: इस अभ्यास को लोड होने में थोड़ा अधिक समय लग सकता है.
अब आइए महत्वपूर्ण परिणाम निकालते हैं! मान लीजिए कि पिछले अभ्यास से निकाले गए परिणाम smoc2_res उपलब्ध हैं।
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ RNA-Seq
अभ्यास निर्देश
परिणाम
smoc2_resकोdata.frame()फंक्शन का उपयोग करके results object से एक data frame के रूप में सेव करें।subset()फंक्शन का उपयोग करके वे महत्वपूर्ण genes निकालें जिनके p-adjusted मान 0.05 (alpha value) से कम हों।
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)
# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)