रीड एलाइनमेंट्स

RNA-Seq विश्लेषण वर्कफ़्लो में, हम सीक्वेंसिंग फ़ैसिलिटी से कच्ची FASTQ सीक्वेंसिंग फाइलें प्राप्त करते हैं. फिर हम हर सैंपल के sequence reads की क्वालिटी का आकलन करते हैं और एलाइनमेंट करके यह निर्धारित करते हैं कि जीनोम पर ये रीड्स कहाँ से आई हैं. रीड्स जहाँ एलाइन होती हैं, उस जानकारी का उपयोग करके हम काउंट मैट्रिक्स बनाते हैं, जिसे हम differential expression analysis शुरू करने के लिए उपयोग करेंगे. काउंट मैट्रिक्स बनाने के लिए क्या क्वांटिफ़ाई किया गया था?