DESeq2 के परिणामों का सारांश
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अब जबकि हमने अपने परिणाम निकाल लिए हैं, हम summary() फंक्शन की मदद से चुने गए alpha स्तर पर कितने differentially expressed genes हैं, उसका अच्छा-सा ओवरव्यू ले सकते हैं। यह up- और down-regulated genes की संख्या/प्रतिशत दिखाएगा, साथ ही independent filtering और हटाए गए outliers के बारे में जानकारी भी देगा.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ RNA-Seq
अभ्यास निर्देश
DESeq2केsummary()फंक्शन का उपयोग करके देखें कि हमारे परिणामsmoc2_resमें कितने genes differentially expressed हैं.
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
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