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Visualiser un modèle de Weibull

Dans cet exercice, nous allons reproduire l’exemple de la vidéo en suivant les étapes :

  • Estimer un modèle de Weibull
  • Définir des « patients imaginaires »
  • Calculer les courbes de survie
  • Créer un data.frame avec les informations des courbes de survie
  • Tracer

Nous allons maintenant nous concentrer sur les deux dernières étapes.

Les packages survival, survminer et reshape2, ainsi que les données GBSG2, sont déjà chargés pour vous dans cet exercice. Le modèle de Weibull wbmod et les données des patients imaginaires newdat que vous avez déjà calculés sont également disponibles.

Cet exercice fait partie du cours

Analyse de survie en R

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Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.

# Use cbind() to combine the information in newdat with t
surv_wbmod_wide <- cbind(newdat, t)
  
# Use melt() to bring the data.frame to long format
surv_wbmod <- melt(surv_wbmod_wide, id.vars = c("___", "___"), variable.name = "surv_id", value.name = "___")
Modifier et exécuter le code