Quantiles de courbe de survie à partir d’un modèle de Weibull
Nous pouvons maintenant estimer la survie des patientes atteintes d’un cancer du sein dans les données GBSG2 à l’aide d’un modèle de Weibull.
La fonction predict() avec type = "quantile" permet de calculer les quantiles de la fonction de répartition. Comme nous l’avons vu jusqu’ici dans ce cours, la fonction de survie est égale à 1 moins la fonction de répartition
(\(S = 1 - D\)). Nous pouvons donc facilement calculer les quantiles de la fonction de survie avec la fonction predict().
Le package survival et les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Cet exercice fait partie du cours
Analyse de survie en R
Instructions
- Estimez un modèle de Weibull pour les patientes atteintes d’un cancer du sein.
- Obtenez le temps auquel la probabilité de survivre au-delà de ce point est de 70 % (en utilisant la fonction
predict()avectype = "quantile").
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Weibull model
wb <- ___(Surv(___, ___) ~ 1, data = GBSG2)
# 70 Percent of patients survive beyond time point...
predict(wb, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(1))