Comparer le modèle de Weibull et l’estimateur de Kaplan-Meier
Traçons la courbe de survie obtenue avec le modèle de Weibull pour les données GBSG2 !
Les packages survival et survminer ainsi que les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Cet exercice fait partie du cours
Analyse de survie en R
Instructions
- Ajustez le modèle de Weibull sur les données
GBSG2. - Calculez la courbe de survie à partir du modèle.
- Tracez les courbes de survie obtenues avec les deux estimateurs.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Weibull model
wb <- ___(___(___, ___) ~ ___, ___)
# Retrieve survival curve from model
surv <- seq(.99, .01, by = -.01)
# Get time for each probability
t <- predict(___, type = ___, p = ___, newdata = data.frame(___))
# Create data frame with the information needed for ggsurvplot_df
surv_wb <- data.frame(time = ___, surv = ___,
upper = NA, lower = NA, std.err = NA)
# Plot
ggsurvplot_df(fit = ___, surv.geom = ___)