Projet final : le modèle de Cox
Pour conclure le cours, revenons sur le jeu de données sur le cancer du poumon que nous avons utilisé brièvement dans les deux derniers chapitres. Pour rappel, ce jeu de données contient des informations sur la survie de patients atteints d’un cancer du poumon avancé, provenant du North Central Cancer Treatment Group. L’événement est stocké dans la variable status, qui prend la valeur 2 si un individu n’a pas survécu. Le score de performance (variable performance) mesure la capacité d’un patient à réaliser ses activités quotidiennes habituelles (mauvais = 0, bon = 100), évaluée par un médecin. Nous voulons connaître l’association entre certains scores de performance et le temps de survie.
Cet exercice fait partie du cours
Analyse de survie en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Compute Cox model and survival curves
cxmod <- ___(___(___, ___) ~ ___, data = lung)
new_lung <- data.frame(performance = ___)
cxsf <- ___(cxmod, data = ___, newdata = ___, conf.type = "none")