Estimer un modèle de Weibull et tracer les courbes de survie
Dans cet exercice, nous allons reproduire l’exemple de la vidéo en suivant les étapes suivantes :
- Estimer un modèle de Weibull
- Définir des « patients imaginaires »
- Calculer les courbes de survie
- Créer un
data.frameavec les informations de courbe de survie - Tracer
Dans cet exercice, nous nous concentrons sur les trois premières étapes. L’exercice suivant couvrira les étapes restantes.
Les packages survival, survminer et reshape2 ainsi que les données GBSG2 sont déjà chargés pour vous dans cet exercice.
Cet exercice fait partie du cours
Analyse de survie en R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Weibull model
wbmod <- survreg(___ ~ ___ + ___, data = GBSG2)
# Imaginary patients
newdat <- expand.grid(
horTh = levels(GBSG2$___),
tsize = quantile(GBSG2$___, probs = c(___, ___, ___)))
newdat