Bilder stapeln
Bild-„Stacks" sind eine hilfreiche Metapher, um mehrdimensionale Daten zu verstehen. Jede höhere Dimension ist ein Stapel von Arrays niedrigerer Dimension.
In dieser Übung nutzen wir NumPys Funktion stack(), um mehrere 2D-Arrays zu einem 3D-Volumen zu kombinieren. Nach Konvention sollten Volumendaten entlang der ersten Dimension gestapelt werden: vol[plane, row, col].
Hinweis: Wenn du Operationen auf einem ImageIO-Objekt vom Typ Image ausführst, wird es in ein numpy.ndarray konvertiert und seine Metadaten gehen verloren.
Diese Übung ist Teil des Kurses
<Kurs>Biomedizinische Bildanalyse mit Python</Kurs>Übungsanweisungen
- Importiere
imageioundnumpy(alsnp). - Lade „chest-220.dcm", „chest-221.dcm" und „chest-222.dcm".
- Erstelle ein 3D-Volumen mit
np.stack(). Setze die Stapel-axisauf 0. - Gib das Attribut
shapevonvolaus.
Interaktive praktische Übung
Versuche dich an dieser Übung, indem du diesen Beispielcode vervollständigst.
# Import ImageIO and NumPy
import imageio.v2 as imageio
import ____ as ____
# Read in each 2D image
im1 = imageio.imread('chest-220.dcm')
im2 = ____
im3 = ____
# Stack images into a volume
vol = np.stack(____)
print('Volume dimensions:', ____)