人类基因组 X 染色体
现在轮到您使用 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 包并从中提取信息了。与视频中一样，您将使用 genes() 函数，并将参数 filter 设为选择 tx_chrom = "chrX" 的实例，从而获取 X 染色体上的所有基因。然后，探索这部分基因的子集。
请记住，filter 接收一个 list()，其中包含用于选择特定基因组区间的筛选条件。
如果您想测试其他筛选条件，此列表可用的名称包括："gene_id"、"tx_id"、"tx_name"、"tx_chrom"、"tx_strand"、"exon_id"、"exon_name"、"exon_chrom"、"exon_strand"、"cds_id"、"cds_name"、"cds_chrom"、"cds_strand" 和 "exon_rank"。
本练习是课程的一部分
R 中的 Bioconductor 入门
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg