搜索模式
让我们使用 vmatchPattern() 在 zikaVirus 集合中查找某个模式的出现位置。接着,使用 matchPattern() 在单条序列 zikv 上进行相同的模式搜索。
# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikv, max.mismatch = 1)
这两个函数应找到相同数量的出现次数,但输出格式会不同。 分别运行每个模式搜索时,我们各得到多少个匹配?
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