GenomicRanges 访问器
在上一个练习中,您从一个包含基本信息的数据框创建了一个 GRanges 对象。您会发现 GRanges 能存储的内容远不止这些!
请使用访问器方法来探索 GRanges 对象 myGR。您可以从 GRanges 对象中提取多种特征,例如染色体名称、序列数量、每个序列的名称、链信息、得分、长度等。
以下是 GRanges 的基本访问器:
seqnames(gr)
ranges(gr)
mcols(gr)
genome(gr)
seqinfo(gr)
如需完整的访问器列表,您可以查看 methods(class = "GRanges")。
本练习是课程的一部分
R 中的 Bioconductor 入门
练习说明
- 获取
myGR的序列信息。 - 使用
mcols()查看元数据。
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Load GenomicRanges
library(___)
# Print the seqinfo of myGR
___
# Check the metadata
___