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常用序列操作函数

到目前为止,您已经学习了最常用的序列操作函数:

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

在实际工作中,您可以用这些函数处理非常大的序列。

不过,为了在本练习中直观看到这些函数的作用和结果,您将使用一个更小的子集。对象 zikv 是您之前从 Zika 基因组中取出的片段,只有 30 个碱基。

本练习是课程的一部分

R 中的 Bioconductor 入门

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练习说明

使用 zikv 测试这些函数:

  • 反转该序列。
  • 计算该序列的互补序列。
  • 计算该序列的反向互补序列。
  • 翻译该序列。

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Reverse the zikv sequence
reverse(___)

# Complement the zikv sequence
___

# Reverse complement the zikv sequence
___

# Translate the zikv sequence
___
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