인간 유전체 X 염색체
이제 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 패키지를 사용해 정보를 추출해 볼 차례예요. 영상에서처럼 genes() 함수를 사용하고, filter 인자를 tx_chrom = "chrX"인 경우를 선택하도록 설정해 X 염색체의 모든 유전자를 부분 선택하세요. 그런 다음, 이렇게 얻은 유전자 하위 집합을 살펴보세요.
filter는 특정 유전체 구간을 선택하기 위한 조건을 list() 형태로 받는다는 점을 기억하세요.
다른 필터를 시도해 보고 싶다면, 이 리스트에서 사용할 수 있는 유효한 이름은 다음과 같아요: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand", "exon_rank".
이 연습은 강의의 일부입니다
R로 시작하는 Bioconductor
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg