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시퀀스 품질 살펴보기

이제 fqsample에 대해 품질 관리 점검을 직접 수행해 보세요. 이는 이후 분석을 시작하기 전에 데이터 문제를 빠르게 파악하기 위한 중요한 단계예요.

quality()에서 각 문자의 인코딩 값을 확인하려면 encoding()을 사용하세요:

encoding(quality(fqsample))

품질 평가(QA) 요약을 보려면 qa()를 사용합니다:

qaSummary <- qa(fqsample, type = "fastq", lane = 1)

이 qaSummary는 이미 생성되어 있어요. QA 요소는 qaSummary[["nameElement"]]처럼 접근할 수 있으며, nameElement는 확인하려는 요소의 이름입니다.

이 연습은 강의의 일부입니다

R로 시작하는 Bioconductor

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실습형 인터랙티브 연습

이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.

# Load ShortRead
library(___)

# Check quality
___(___)
코드 편집 및 실행