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연습 문제

전사체는 몇 개일까요?

영상에서 관심 유전자의 한 전사체에 있는 엑손 길이를 구했던 것을 기억하시나요? 이제는 ABCD1 유전자가 전사체를 몇 개 가지고 있는지 직접 찾아보세요. 아래를 사용하면 됩니다:

transcriptsBy(x, by = "gene")

유전자별 모든 전사체를 얻은 뒤에는 id로 원하는 유전자를 선택할 수 있어요. ABCD1의 유전자 id는 215입니다. 특정 유전자의 정보를 선택할 때는 유전자 id를 백틱으로 감싸면 편리해요. 예를 들어 transcripts$`215`처럼요.

지침

100 XP
  • 사람 전사체 DB를 hg로 로드하세요.
  • seqlevels()를 사용해 X 염색체로 미리 필터링하세요.
  • hg에서 "gene" 기준으로 모든 전사체를 가져와 hg_chrXt에 저장하고 출력하세요.
  • $를 사용해 hg_chrXt에서 유전자 `215`를 선택하세요.