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여섯 개 프레임에서 보존 구역 찾기

여기까지 오시느라 정말 수고하셨어요!

이제 지카 바이러스 서열에서 NS5 단백질 서열을 찾아볼 거예요. NS5는 바이러스에서 매우 보존적인 단백질입니다. 이 서열은 Uniprot에서 내려받아 미리 불러왔어요.

지카 바이러스의 DNA 서열은 RNAStringSet인 rnaframesZikaSet으로 전사되어 있습니다. 이 집합에는 6개의 리딩 프레임(각 서열당 하나)이 들어 있고, 이를 아미노산으로 번역할 수 있어요. 검색할 때는 vcountPattern()을 호출하면서 max.mismatch 인수를 설정해 검색에 유연성을 더할 거예요.

Instrukcje 1 / 3

undefined XP
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  • rnaframesZikaSet을 출력하세요.
  • 6개의 리딩 프레임을 모두 아미노산으로 번역하고 결과를 출력하세요.