GenomicRanges 접근자
이전 연습 문제에서는 기본 정보를 담은 데이터 프레임에서 GRanges 객체를 만들었어요. 사실 GRanges에는 훨씬 더 많은 정보를 저장할 수 있어요!
접근자 메서드를 사용해 GRanges 객체인 myGR를 탐색해 보세요. 염색체 이름, 서열 수, 각 서열의 이름, 가닥(strand) 정보, 점수(score), 길이 등 GRanges 객체에서 다양한 특성을 추출할 수 있어요.
다음은 GRanges의 기본 접근자예요:
seqnames(gr)
ranges(gr)
mcols(gr)
genome(gr)
seqinfo(gr)
전체 접근자 목록은 methods(class = "GRanges")에서 확인할 수 있어요.
이 연습은 강의의 일부입니다
R로 시작하는 Bioconductor
연습 안내
myGR의 서열 정보를 가져오세요.mcols()를 사용해 메타데이터를 확인하세요.
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Load GenomicRanges
library(___)
# Print the seqinfo of myGR
___
# Check the metadata
___