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연습 문제

지카 바이러스 서열 살펴보기

이제 작업 공간에 zikaVirus로 불러온 지카 바이러스 유전체를 탐색해 볼 차례예요. 이 유전체는 NCBI에서 내려받았고, Biostrings 함수들을 적용해 더 알아볼 수 있어요.

먼저, 서열의 알파벳을 확인해 보세요.

alphabet() # 서열에 포함된 문자(알파벳)를 보여줘요
alphabetFrequency() # 문자별 등장 빈도를 보여줘요

영상에서 보셨듯이, 각 알파벳은 특정 biostring 컨테이너에 해당하고, 대부분의 알파벳에는 추가 코드 문자와 기호가 포함돼 있어요.

지침 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • alphabet()을 사용해 zikaVirus에 어떤 문자가 포함되어 있는지 확인하세요.