지카 바이러스 서열 살펴보기
이제 작업 공간에 zikaVirus로 불러온 지카 바이러스 유전체를 탐색해 볼 차례예요. 이 유전체는 NCBI에서 내려받았고, Biostrings 함수들을 적용해 더 알아볼 수 있어요.
먼저, 서열의 알파벳을 확인해 보세요.
alphabet() # 서열에 포함된 문자(알파벳)를 보여줘요
alphabetFrequency() # 문자별 등장 빈도를 보여줘요
영상에서 보셨듯이, 각 알파벳은 특정 biostring 컨테이너에 해당하고, 대부분의 알파벳에는 추가 코드 문자와 기호가 포함돼 있어요.
이 연습은 강의의 일부입니다
R로 시작하는 Bioconductor
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
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