Théorie de l'EDG : métadonnées
À partir des renseignements ci-dessous, créez un tableau de données de métadonnées pour les décomptes liés à la fibrose, nommé metadata, avec les colonnes genotype et condition. Les noms d'échantillons (p. ex. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2, etc.) doivent être les noms de lignes du tableau :
Cette activité fait partie du cours
RNA-Seq avec Bioconductor dans R
Instructions de l’exercice
- Créez un vecteur de caractères nommé
genotypepour les données ci-dessus à l'aide dec(). - Créez un vecteur de caractères nommé
conditionpour les données ci-dessus à l'aide dec(). - Créez un tableau de données nommé
smoc2_metadataà l'aide dedata.frame()et des vecteurs de caractèresgenotypeetcondition. - Créez un vecteur de noms d'échantillons à l'aide de
c()et assignez-le aux noms de lignes du tableau de données avecrownames().
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Create genotype vector
genotype <- c(___)
# Create condition vector
condition <- c(___)
# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)
# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)