S'exercer avec la vignette DESeq2

Dans les vidéos, nous examinons les différences d'expression génique entre les échantillons normaux et fibrosés de souris de type sauvage. Dans ces exercices, nous allons explorer l'expression génique entre les échantillons normaux et fibrosés de souris qui sur‑expriment le gène smoc2.

Lorsque vous réalisez vous‑même des analyses d'expression différentielle, la vignette DESeq2 est la première ressource à consulter pour répondre à vos questions. Dans cet exercice, parcourez la vignette DESeq2 et servez‑vous‑en pour choisir la meilleure réponse ci‑dessous à la question :

Pourquoi utilisons‑nous des décomptes non normalisés comme entrée pour DESeq2 ?

REMARQUE : Non normalisé signifie que les décomptes n'ont pas été ajustés selon la taille de la bibliothèque, soit le nombre total de lectures comptées par échantillon.