Paquets pour l'ARN-Seq
Nous utiliserons DESeq2 pour réaliser l'analyse d'expression différentielle, ainsi que d'autres paquets R pour la préparation des données et la visualisation. Avant de lancer toute analyse, nous devons charger les paquets suivants : DESeq2, RColorBrewer, pheatmap et tidyverse.
Cette activité fait partie du cours
RNA-Seq avec Bioconductor dans R
Instructions de l’exercice
- À l'aide de
library(), importez les paquetsDESeq2,RColorBrewer,pheatmapettidyverse.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Load library for DESeq2
library(___)
# Load library for RColorBrewer
library(___)
# Load library for pheatmap
library(___)
# Load library for tidyverse
library(___)