Résumer les résultats DESeq2
REMARQUE : Le chargement de cet exercice peut prendre un peu plus de temps.
Maintenant que nous avons extrait nos résultats, nous pouvons obtenir un bon aperçu du nombre de gènes différentiellement exprimés pour le niveau alpha choisi à l'aide de la fonction summary(). Elle affichera les nombres/percentages de gènes à la hausse et à la baisse, ainsi que de l'information sur le filtrage indépendant et les valeurs aberrantes retirées.
Cette activité fait partie du cours
RNA-Seq avec Bioconductor dans R
Instructions de l’exercice
- Vérifiez combien de gènes sont différentiellement exprimés dans nos résultats,
smoc2_res, à l'aide de la fonctionsummary()deDESeq2.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Get an overview of the results
___