DGE-Theorie: Metadaten

Verwende die Informationen unten, um für die Fibrose-Zähldaten einen Metadaten-Datenrahmen namens metadata mit den Spalten genotype und condition zu erstellen. Die Probennamen (z. B. smoc2_fibrosis1, smoc2_fibrosis2 usw.) sollen die Zeilennamen des Datenrahmens sein:

smoc2 metadata

Diese Übung ist Teil des Kurses

RNA-Seq mit Bioconductor in R

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Anleitung zur Übung

Erstelle einen Zeichenkettenvektor namens genotype für die obigen Daten mit c().
Erstelle einen Zeichenkettenvektor namens condition für die obigen Daten mit c().
Erstelle einen Datenrahmen namens smoc2_metadata mit data.frame() und den Zeichenkettenvektoren genotype und condition.
Erstelle einen Vektor mit Probennamen mittels c() und weise ihn den Zeilennamen des Datenrahmens mit rownames() zu.

Interaktive Übung

Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)

Code bearbeiten und ausführen