DESeq2-Ergebnisse zusammenfassen
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Nachdem wir unsere Ergebnisse extrahiert haben, können wir uns mit der Funktion summary() einen guten Überblick darüber verschaffen, wie viele Gene bei unserem festgelegten Alpha-Niveau differentiell exprimiert sind. Sie gibt die Zahlen/Prozentanteile der hoch- und herunterregulierten Gene aus und liefert außerdem Informationen über unabhängiges Filtern und entfernte Ausreißer.
Diese Übung ist Teil des Kurses
RNA-Seq mit Bioconductor in R
Anleitung zur Übung
- Prüfe mit der
summary()-Funktion vonDESeq2, wie viele Gene in unseren Ergebnissensmoc2_resdifferentiell exprimiert sind.
Interaktive Übung
Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.
# Get an overview of the results
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