DESeq2-Ergebnisse zusammenfassen
HINWEIS: Das Laden dieser Übung kann etwas länger dauern.
Nachdem wir unsere Ergebnisse extrahiert haben, können wir uns mit der Funktion summary() einen guten Überblick darüber verschaffen, wie viele Gene bei unserem festgelegten Alpha-Niveau differentiell exprimiert sind. Sie gibt die Zahlen/Prozentanteile der hoch- und herunterregulierten Gene aus und liefert außerdem Informationen über unabhängiges Filtern und entfernte Ausreißer.
Diese Übung ist Teil des Kurses
<Kurs>RNA-Seq mit Bioconductor in R</Kurs>Übungsanweisungen
- Prüfe mit der
summary()-Funktion vonDESeq2, wie viele Gene in unseren Ergebnissensmoc2_resdifferentiell exprimiert sind.
Interaktive praktische Übung
Versuche dich an dieser Übung, indem du diesen Beispielcode vervollständigst.
# Get an overview of the results
___