Üben mit der DESeq2-Vignette

In den Videos untersuchen wir Expressionsunterschiede zwischen normalen und Fibrose-Proben von Wildtyp-Mäusen. In diesen Übungen betrachten wir die Genexpression zwischen normalen und Fibrose-Proben von Mäusen, die das smoc2-Gen überexprimieren.

Wenn du eigene Analysen zur differentiellen Expression durchführst, ist die DESeq2-Vignette die erste Anlaufstelle für Antworten auf Fragen. Durchsuche in dieser Übung die DESeq2-Vignette und nutze sie, um die beste Antwort auf folgende Frage auszuwählen:

Warum verwenden wir unnormalized Counts als Eingabe für DESeq2?

HINWEIS: Unnormalized bedeutet, dass die Counts nicht an die Bibliotheksgröße angepasst wurden, also die Gesamtzahl der Reads pro Probe.